Çankaya Lisesi 1968-1969 öğretim yılı başında eğitim ve öğretime açılmıştır. O tarihte Ayrancı Ortaokulu binası olarak yapılan A Blokta 330 öğrenci ve 6 şube ile faaliyete geçmiştir.Bina yetersizliği nedeniyle bazı şubeler okulun arka kısmındaki prefabrik barakalarda ders yapmak zorunda kalmıştır. Daha sonra bina Çankaya Lisesi orta kısmı olarak Bakanlık emirleri gereği işlem görmüştür. Lise ilk mezunlarını 1971 yılında vermiştir. Mevcut bina ihtiyaca cevap vermediği için 1971 yılında dört katlı ek bina inşa edilerek okulun kapasitesi arttırılmıştır. Okulun arka cephesindeki barakalar yıkılarak yerine kapalı spor salonu yapımına 1974 yılında başlanmıştır. Spor salonu 1979 yılında hizmete açılmıştır.  1992 yılında lise bünyesinde yabancı dil ağırlıklı lise faaliyete geçmiştir. Yabancı dil ağırlıklı lisemiz ilk mezunlarını cübbe ve kepli mezuniyet töreni ile Cumhurbaşkanımız Sayın Süleyman Demirel'in huzuruna çıkarak vermiştir. Okul binası ve bahçesinin yenileme çalışmaları 2011-2015 yıllarında devam etmiş olup, okulumuzun giriş, Atatürk Köşesi, koridorlar, tuvaletler, sınıflar, Fizik, Kimya Biyoloji Laboratuarları, Kütüphane gibi birçok bölümü yenilenmiş ve daha modern bir hale getirilmiştir. Tüm dersliklere Milli Eğitim Bakanlığı tarafından akıllı tahta ve hızlı internet bağlantısı kurulmuştur. Çankaya Lisesi bu kırk yedi yıllık tarihinde nice devlet adamları, büyük iş adamları, kültür, sanat, spor ve müzik alanlarında da isim yapmış kişiler yetiştirmiştir. Çankaya Lisesi günümüzde de birçok sosyal, kültürel ve sportif faaliyetlerde adını duyurmaktadır. 2010-2011 Eğitim Öğretim Yılından itibaren Anadolu Lisesi statüsü kazanan okulumuz 2012 ÖSYM verilerine göre 2012 LYS sınavında kendi türünde Ankara il birincisi, Türkiye yedincisi olmuştur. 2012-2013 yılında son genel lise öğrencileri okul bahçesinde düzenlenen mezuniyet ve kep atma töreni ile mezun olmuştur.2014 yılında Çankaya ilçesi ortaöğretim kurumları kategorisinde yılın en kaliteli kurumu seçilmiştir.

    Okulumuz her yıl Akademik, Sosyal, Kültürel ve Sportif başarılarını artırarak Eğitim ve Öğretime devam etmektedir. Okulda 34 derslik, Z-Kütüphane, Müzik Odası, Toplantı Salonu, Fizik, Kimya, Biyoloji laboratuvarları, Görsel Sanatlar Sınıfı, Rehberlik Sınıfı Kapalı spor salonu ve diğer birimlerle birlikte (kız 486 – erkek 536 toplamda 1012 Öğrenci) ve 70 çalışan ile öğretim hizmeti sunulmaktadır.

2020-2021 Eğitim ve Öğretim yılında 11-A,B,C,D,E İle 12-A,B,C Sınıflarımız Sayısal,11-S,  G, H, 12-D Eşit ağırlık,11-K,12-E Dil Sınıflarımızdır